RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 GLB1LQ6UWU2 654 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 NOSTRINQ8IVI9 506 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 IGSF22Q8N9C0 903 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 GNRHR2Q96P88 292 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 MEGF9Q9H1U4 602 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 BTBD7Q9P203 1132 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ADAM29Q9UKF5 820 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 RASSF10A6NK89 507 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 GSG1L2A8MUP6 293 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 M0R2C6 588 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 GAS7O60861 476 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PTGS1P23219 599 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 AOAHP28039 575 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 STAT3P40763 770 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 SCNN1BP51168 640 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ANAPC15P60006 121 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PPP2CBP62714 309 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PPP2CAP67775 309 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ADAM17P78536 824 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 WDR72Q3MJ13 1102 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM177Q53S58 311 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF585AQ6P3V2 769 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 OVCH1Q7RTY7 1134 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PLEKHH3Q7Z736 793 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ASB15Q8WXK1 588 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 AMNQ9BXJ7 453 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 INCENPQ9NQS7 918 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 JAG2Q9Y219 1238 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-208ENST00000427110 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 NPTXRO95502 500 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 MPIG6BO95866 241 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CPEP16870 476 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF20P17024 532 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 GJA4P35212 333 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 KCNQ1P51787 676 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 IL2P60568 153 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 IGBP1P78318 339 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CD83Q01151 205 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 STRN3Q13033 797 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 KRT26Q7Z3Y9 468 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 RNF180Q86T96 592 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 PALM2Q8IXS6 379 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CHST14Q8NCH0 376 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 HIPK4Q8NE63 616 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CHST13Q8NET6 341 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 OR2W6PQ8NHA6 318 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 USP7Q93009 1102 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 GPATCH3Q96I76 525 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 AJUBAQ96IF1 538 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 GPR20Q99678 358 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 MCM8Q9UJA3 840 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 SLC12A8A0AV02 714 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 PTPDC1A2A3K4 754 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 FOXP2O15409 715 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 HIP1RO75146 1068 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 VIL1P09327 827 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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PTPRC-208ENST00000427110 STAT5BP51692 787 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 EPHB4P54760 987 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 IRF9Q00978 393 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 USP10Q14694 798 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 SURF1Q15526 300 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 RNF151Q2KHN1 245 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 OTOP2Q7RTS6 562 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 NXPE1Q8N323 547 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 ATL2Q8NHH9 583 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 SAMD11Q96NU1 681 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-208ENST00000427110 GBP4Q96PP9 640 aa3.39□□□□□ -1.87
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