RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410499.1

RNU6-141P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 141, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-141P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-141P-201ENST00000410499 CRTC3Q6UUV7 619 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 UROC1Q96N76 676 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 CLIP2Q9UDT6 1046 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 LINC01548A6NM66 108 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 UPK3BL1B0FP48 263 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 UPK3BL2E5RIL1 263 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 GSTM1P09488 218 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TNNI2P48788 182 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 LMO4P61968 165 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 BFSP2Q13515 415 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 AKNAD1Q5T1N1 836 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 PXDC1Q5TGL8 231 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 ABHD17BQ5VST6 288 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TEPPQ6URK8 271 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 CAPN12Q6ZSI9 719 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 ASB10Q8WXI3 467 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 SARAFQ96BY9 339 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 PDLIM2Q96JY6 352 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 CAMK1GQ96NX5 476 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 CHST7Q9NS84 486 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 RYR1P21817 5038 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 LACTBL1A8MY62 500 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 LIG3P49916 1009 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 FCRLBQ6BAA4 426 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 SPINK14Q6IE38 97 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 ADAM5Q6NVV9 412 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 RAPH1Q70E73 1250 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 CCDC74AQ96AQ1 378 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZPBPQ9BS86 351 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 YIPF4Q9BSR8 244 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC12A9Q9BXP2 914 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 AHRRA9YTQ3 701 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC26A4O43511 780 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TFF2Q03403 129 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 RETREG2Q8NC44 543 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 SCYL1Q96KG9 808 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 AP5M1Q9H0R1 490 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 MLXIPLQ9NP71 852 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 KCND1Q9NSA2 647 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 USH2AO75445 5202 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 PMS2P1A4D2B8 440 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 GFRA2O00451 464 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 PAGE1O75459 146 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 LRG1P02750 347 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 POLD1P28340 1107 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 MPGP29372 298 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 RIN1Q13671 783 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TWIST1Q15672 202 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 PIK3R6Q5UE93 754 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC18B1Q6NT16 456 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 USP30Q70CQ3 517 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 GDF7Q7Z4P5 450 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 MILR1Q7Z6M3 343 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 BMPERQ8N8U9 685 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 UHRF2Q96PU4 802 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 EGFL8Q99944 293 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC46A2Q9BY10 475 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 CDCP1Q9H5V8 836 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 DTLQ9NZJ0 730 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 FBXL17Q9UF56 701 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.47□□□□□ -2.48
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRIM24O15164 1050 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 MYF6P23409 242 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 HGFACQ04756 655 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 DTHD1Q6ZMT9 781 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF66Q6ZN08 573 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 STPG3Q8N7X2 389 aa-0.48□□□□□ -2.49
RNU6-141P-201ENST00000410499 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms