RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

BASIC

Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 PDLIM7Q9NR12 457 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCND2Q9NZV8 630 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 WDR90Q96KV7 1748 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 A0A1W2PQC6 194 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PDXKO00764 312 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CETN3O15182 167 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPP1R37O75864 691 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 KIF20AO95235 890 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARIH2O95376 493 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GCNT3O95395 438 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GYPCP04921 128 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TGFB3P10600 412 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PLS3P13797 630 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CASP4P49662 377 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SOX10P56693 466 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 HUNKP57058 714 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NEDD9Q14511 834 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCTD2Q14681 263 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SYCP1Q15431 976 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAN2A1Q16706 1144 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ODR4Q5SWX8 454 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPFIBP1Q86W92 1011 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM178BQ8IXR5 827 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 COPS5Q92905 334 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CEP170P1Q96L14 293 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CEP89Q96ST8 783 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NDST4Q9H3R1 872 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GPRC5CQ9NQ84 441 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF302Q9NR11 478 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCND1Q9NSA2 647 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DMAC2Q9NW81 257 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PNMA3Q9UL41 463 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SCN4AP35499 1836 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PARP14Q460N5 1801 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TTC26A0AVF1 554 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ASB14A6NK59 587 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PES1O00541 588 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC16A4O15374 487 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 STX10O60499 249 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MFAP3LO75121 409 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 AKAP3O75969 853 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GGPS1O95749 300 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GNA14O95837 355 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NR3C1P04150 777 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 TPM2P07951 284 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 FECHP22830 423 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NR2F2P24468 414 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 ADORA2AP29274 412 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 KRT9P35527 623 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 STAT5BP51692 787 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 MARSP56192 900 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PEX3P56589 373 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCNA1P78396 465 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 GTF2BQ00403 316 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 PRKCEQ02156 737 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 NFIL3Q16649 462 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD66.1-201ENST00000391230 XKR3Q5GH77 459 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms