RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	HOXC8	P31273	242 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	SNX17	Q15036	470 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	STK17A	Q9UEE5	414 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	EYA4	O95677	639 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	FSIP1	Q8NA03	581 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	CEP170P1	Q96L14	293 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	PLIN2	Q99541	437 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	PFKFB1	P16118	471 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	STAT6	P42226	847 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	RARRES1	P49788	294 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	CDK7	P50613	346 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	MTERF2	Q49AM1	385 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	XKR9	Q5GH70	373 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	SETD4	Q9NVD3	440 aa		27.61	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ARID2	Q68CP9	1835 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM150B	A6NC51	233 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	UBE2H	P62256	183 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	IGBP1	P78318	339 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	PDILT	Q8N807	584 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	IQUB	Q8NA54	791 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	CUEDC2	Q9H467	287 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	HPSE	Q9Y251	543 aa		27.6	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782		A0A1B0GVL5	298 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782		E9PMD0	336 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ZBTB39	O15060	712 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	MAGEB2	O15479	319 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	RFC5	P40937	340 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	NPEPPS	P55786	919 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	KCNK18	Q7Z418	384 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	RAD54L	Q92698	747 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782		A0A087X0B3	334 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ADAM17	P78536	824 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782	KAT6A	Q92794	2004 aa		27.58	■■■□□ 2.01
GKAP1-204	ENST00000388782		A0A087WWV3	80 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	DGAT1	O75907	488 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	C22orf31	O95567	290 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	PLA2G4B	P0C869	781 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	SYK	P43405	635 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	PTGIS	Q16647	500 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	RETREG2	Q8NC44	543 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	DHX58	Q96C10	678 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	TOX2	Q96NM4	488 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	CEP89	Q96ST8	783 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	PANK2	Q9BZ23	570 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	USP25	Q9UHP3	1055 aa		27.57	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	KLRC1	P26715	233 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	NDUFA8	P51970	172 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	RTP1	P59025	263 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	E2F4	Q16254	413 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	TRIM60	Q495X7	471 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		27.56	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	B4GALT4	O60513	344 aa		27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC12A3	P55017	1021 aa		27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	HIC1	Q14526	733 aa		27.55	■■■□□ 2
GKAP1-204	ENST00000388782	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		27.55	■■■□□ 2

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