RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF18P17022 549 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 HDAC11Q96DB2 347 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 POTEFA5A3E0 1075 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 NR3C1P04150 777 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 POTEIP0CG38 1075 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 SURF1Q15526 300 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 POTEGQ6S5H5 508 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 TBK1Q9UHD2 729 aa22.71■■□□□ 1.23
SMURF1-201ENST00000361125 ALX1Q15699 326 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 NT5C2P49902 561 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 MCUQ8NE86 351 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 TCP11Q8WWU5 503 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 F5H6K3 240 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 AKR1B1P15121 316 aa22.7■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 KLRC3Q07444 240 aa22.7■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 GUCY1A2P33402 732 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 RNF146Q9NTX7 359 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CHRNA5P30532 468 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 GCLMP48507 274 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 IFT88Q13099 833 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 USP31Q70CQ4 1352 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 TDP2O95551 362 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SPP2Q13103 211 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 MAP7Q14244 749 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF6Q15052 776 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ERICH1Q86X53 443 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 PASD1Q8IV76 773 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 BAG2O95816 211 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 MSH2P43246 934 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 IL9RQ01113 521 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SP8Q8IXZ3 490 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.69■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 DR1Q01658 176 aa22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 NNTQ13423 1086 aa22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 WDR64B1ANS9 1081 aa22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 BBS5Q8N3I7 341 aa22.68■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF302Q9NR11 478 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 RNF14Q9UBS8 474 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CHGBP05060 677 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 PSMA2P25787 234 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ATP8B3O60423 1300 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC53A6NM62 1247 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ANXA13P27216 316 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CLDN3O15551 220 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 PALMO75781 387 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SATB1Q01826 763 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.67■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.67■■□□□ 1.22
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SMURF1-201ENST00000361125 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 MTRQ99707 1265 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CEP72Q9P209 647 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SESN3P58005 492 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SNCBQ16143 134 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 FOXN1O15353 648 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 LGALS16A8MUM7 142 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SRGAP2O75044 1071 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 ALS2CLQ60I27 953 aa22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 MUM1Q2TAK8 710 aa22.65■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 SEPT6Q14141 434 aa22.65■■□□□ 1.22
SMURF1-201ENST00000361125 MMEL1Q495T6 779 aa22.65■■□□□ 1.22
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