RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 EHD2Q9NZN4 543 aa20.58■□□□□ 0.89
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SH3BP1-201ENST00000357436 RPA1P27694 616 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 GGCXP38435 758 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 PTGER2P43116 358 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNH2Q12809 1159 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC31Q6UY01 552 aa20.58■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 DNM3Q9UQ16 869 aa20.56■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.56■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 SFI1A8K8P3 1242 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 KLRC1P26715 233 aa20.56■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 ALAS1P13196 640 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.55■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.55■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.55■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A14Q96JA4 679 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFRSF8P28908 595 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 CIITAP33076 1130 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 ARID5AQ03989 594 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 ASIC2Q16515 512 aa20.54■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 IL31RAQ8NI17 732 aa20.54■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.53■□□□□ 0.88
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SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 WRNIP1Q96S55 665 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 PDXKO00764 312 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 RSPH10BP0C881 870 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 VAV3Q9UKW4 847 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-201ENST00000357436 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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