RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.39■■□□□ 1.18
NISCH-201ENST00000345716 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 RASA1P20936 1047 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 NLRP4Q96MN2 994 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 MEGF6O75095 1541 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ANO9A1A5B4 782 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SLC16A4O15374 487 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CCT5P48643 541 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.39■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CHRNA5P30532 468 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SURF1Q15526 300 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 STXBP2Q15833 593 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 MED7O43513 233 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 GABPAQ06546 454 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 DPYDQ12882 1025 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 WHAMMQ8TF30 809 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CCDC160A6NGH7 325 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 IFNAR2P48551 515 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 DR1Q01658 176 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 FGGP02679 453 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 LXNQ9BS40 222 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 GIPC1O14908 333 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R5CQ13362 524 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 DYNLT1P63172 113 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 KSR1Q8IVT5 923 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 HPS3Q969F9 1004 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 NFU1Q9UMS0 254 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 DEPDC5O75140 1603 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 MTF1Q14872 753 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 C7orf31Q8N865 590 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 RWDD2BP57060 319 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SNX25Q9H3E2 840 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 FBXO40Q9UH90 709 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 A0A1B0GTH6 734 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 LRRD1A4D1F6 860 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 RASSF2P50749 326 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 NNTQ13423 1086 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 Q3C1V9 767 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CCDC188H7C350 402 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 LDHDQ86WU2 507 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ADSSL1Q8N142 457 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 STXBP3O00186 592 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ABL1P00519 1130 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SFNP31947 248 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 PCK1P35558 622 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ALS2CLQ60I27 953 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 EMBQ6PCB8 327 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 FMO2Q99518 471 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 SPATA24Q86W54 205 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 DENND3A2RUS2 1198 aa22.34■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 NAA25Q14CX7 972 aa22.34■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.34■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CALN1Q9BXU9 219 aa22.34■■□□□ 1.17
NISCH-201ENST00000345716 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.34■■□□□ 1.17
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