RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 COASYQ13057 564 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ERICH1Q86X53 443 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 RASSF4Q9H2L5 321 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE1BQ01064 536 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP27A1Q02318 531 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 LDHDQ86WU2 507 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 NCAPGQ9BPX3 1015 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ANAPC5Q9UJX4 755 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM71BQ8TC56 605 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 LPAR1Q92633 364 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP72Q9P209 647 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC12Q9UKB3 198 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 FLT1P17948 1338 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 MOCS3O95396 460 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 SCYL1Q96KG9 808 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 MTRQ99707 1265 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 GABBR1Q9UBS5 961 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO3AQ8NEV4 1616 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 XPAP23025 273 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 VCX3BQ9H321 246 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTN1P12814 892 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD6Q8NC69 237 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6B3Q8NGW1 331 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF568Q3ZCX4 644 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 STOX1Q6ZVD7 989 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 EPB41L5Q9HCM4 733 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 DENND3A2RUS2 1198 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM35BQ8NCS4 154 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 MMP19Q99542 508 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 BPIFA3Q9BQP9 254 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 TDP2O95551 362 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ELF1P32519 619 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ARPP19P56211 112 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 VCXQ9H320 206 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ASB14A6NK59 587 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 PRCPP42785 496 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF543Q08ER8 600 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 EPHA7Q15375 998 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP55Q53EZ4 464 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 MICALL2Q8IY33 904 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 STAG2Q8N3U4 1231 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 LXNQ9BS40 222 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 NYAP2Q9P242 653 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 POTEFA5A3E0 1075 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC16A4O15374 487 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 GSTA1P08263 222 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 GSTA2P09210 222 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 POTEIP0CG38 1075 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 POTEGQ6S5H5 508 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP57Q96MR6 1250 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP8B1O43520 1251 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 PLTPP55058 493 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ITPK1Q13572 414 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf50Q6ZRC1 276 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 GPATCH11Q8N954 259 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ECE1P42892 770 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAAF3Q8N9W5 541 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPS2Q9BXY5 557 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JLW4 131 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 CPP00450 1065 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP1A2P50993 1020 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGCS2P54868 508 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 RWDD2BP57060 319 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 NAALADL2Q58DX5 795 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX1Q13596 522 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 COG2Q14746 738 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 PSMD6Q15008 389 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM5Q71RC9 77 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT10P13645 584 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 SAT1P21673 171 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXD10P28358 340 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DONSONQ9NYP3 566 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP4-201ENST00000344528 DIP2AQ14689 1571 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms