RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
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HOXD4-201ENST00000306324 SYN1P17600 705 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 KLRC1P26715 233 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 UBA7P41226 1012 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 PTK7Q13308 1070 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 ECM1Q16610 540 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CABP7Q86V35 215 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 SERINC5Q86VE9 423 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA32Q96LK8 384 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 TBX21Q9UL17 535 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM43BA6NCK2 446 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 ME1P48163 572 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 NPEPPSP55786 919 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 XKR9Q5GH70 373 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CEP170P1Q96L14 293 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 NACC1Q96RE7 527 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXD4-201ENST00000306324 MUTP22033 750 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXD4-201ENST00000306324 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 WNT8BQ93098 351 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 EPSTI1Q96J88 318 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 HIPK3Q9H422 1215 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.95■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 LTBP2Q14767 1821 aa24.95■■□□□ 1.59
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0355O15063 1070 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 C22orf31O95567 290 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 RAG1P15918 1043 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 METTL13Q8N6R0 699 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 PLIN2Q99541 437 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 BFSP2Q13515 415 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 USP49Q70CQ1 688 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CALML4Q96GE6 196 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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HOXD4-201ENST00000306324 MAGEB2O15479 319 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CUTAO60888 179 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
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HOXD4-201ENST00000306324 RETREG2Q8NC44 543 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CAGE1Q8TC20 777 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 PNMA5Q96PV4 448 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CYP2C18P33260 490 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXD4-201ENST00000306324 RARRES1P49788 294 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 GRB10Q13322 594 aa24.92■■□□□ 1.58
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HOXD4-201ENST00000306324 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CEP89Q96ST8 783 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CCSER1Q9C0I3 900 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 DNM3Q9UQ16 869 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 E9PMD0 336 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 TIMP1P01033 207 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 ITGB8P26012 769 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 HYIQ5T013 277 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 RSPH3Q86UC2 560 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 PPME1Q9Y570 386 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 PITPNM1O00562 1244 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 SLC26A4O43511 780 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CKBP12277 381 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXD4-201ENST00000306324 CLCN3P51790 818 aa24.9■■□□□ 1.58
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