RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299441.4

DCHS1-201, Transcript of dachsous cadherin-related 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DCHS1, Length 10,765 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1-201ENST00000299441 HLFQ16534 295 aa15□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 MT-ND3P03897 115 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 DPYSL4O14531 572 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 TMEM206Q9H813 350 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 RNF181Q9P0P0 153 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 CUEDC2Q9H467 287 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 DISP1Q96F81 1524 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 RNF135Q8IUD6 432 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 COG4Q9H9E3 785 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 POTEMA6NI47 508 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 MAN2A1Q16706 1144 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PIM2Q9P1W9 311 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 STK17AQ9UEE5 414 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PEX19P40855 299 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 RBBP7Q16576 425 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 CYP27A1Q02318 531 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ARMCX2Q7L311 632 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SYNE4Q8N205 404 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 IFT43Q96FT9 208 aa14.99□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 MCAMP43121 646 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 AP1B1Q10567 949 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 GINM1Q9NU53 330 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SUSD4Q5VX71 490 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 HIPK4Q8NE63 616 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 NEDD4P46934 1319 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ADORA2BP29275 332 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 AK8Q96MA6 479 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 CASP1P29466 404 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ERICH1Q86X53 443 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L15C9J2P7 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L11C9JVI0 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L18D6R9N7 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L22D6RA61 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L19D6RCP7 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L20D6RJB6 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SNAP23O00161 211 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 DFFAO00273 331 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ATP6V1E1P36543 226 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L24Q0WX57 530 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 DRP2Q13474 957 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SNCBQ16143 134 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 OSBP2Q969R2 916 aa14.98□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 CYP21A2P08686 494 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PAGE5Q96GU1 130 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 MYH3P11055 1940 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SPATA33Q96N06 139 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 STAT3P40763 770 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 MASTLQ96GX5 879 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 GRAPQ13588 217 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 TMEM270Q6UE05 265 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 ADGRL2O95490 1459 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 SLC16A4O15374 487 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 TBCCQ15814 346 aa14.97□□□□□ -0.01
DCHS1-201ENST00000299441 TSPY1Q01534 308 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms