RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.49■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 CASP10Q92851 521 aa18.49■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 MYL10Q9BUA6 226 aa18.49■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.49■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.49■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 DENND3A2RUS2 1198 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 E7EWF7 191 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 BRD1O95696 1058 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 IGHDP01880 384 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 SP100P23497 879 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ITIH3Q06033 890 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 CES5AQ6NT32 575 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 TCF25Q9BQ70 676 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 SPZ1Q9BXG8 430 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 RGS18Q9NS28 235 aa18.48■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 RPS6KA5O75582 802 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 KIF5BP33176 963 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 CLCN5P51795 746 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 PTH1RQ03431 593 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 UBE2SQ16763 222 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 LLGL2Q6P1M3 1020 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 PCYT2Q99447 389 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ADAM2Q99965 735 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 APOL5Q9BWW9 433 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 PSTPIP2Q9H939 334 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.47■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 C2CD4DB7Z1M9 353 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 C9IYK1 514 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 MGEA5O60502 916 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 NEFLP07196 543 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 PPM1AP35813 382 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ANTXR2P58335 489 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 PLCB4Q15147 1175 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ADAM7Q9H2U9 754 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 CWH43Q9H720 699 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 JADE2Q9NQC1 790 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM161AQ9NX61 479 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC9A2Q9UBY0 812 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 GINS2Q9Y248 185 aa18.46■□□□□ 0.55
CLEC1B-201ENST00000298527 EVPLQ92817 2033 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 DMDP11532 3685 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 CACNA1AO00555 2505 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 GPR182O15218 404 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 DDAH1O94760 285 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 SMARCA1P28370 1054 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC26A2P50443 739 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 STAT5BP51692 787 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 KRT17Q04695 432 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 APOBRQ0VD83 1088 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 ADSSL1Q8N142 457 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 MAP3K14Q99558 947 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 POMKQ9H5K3 350 aa18.45■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 HIDE1A8MVS5 230 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 HOXA2O43364 376 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 PDE4AP27815 886 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 MTHFRP42898 656 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 AAMPQ13685 434 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 TMC7Q7Z402 723 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 LZTS2Q9BRK4 669 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 HCSTQ9UBK5 93 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 PCDHA6Q9UN73 950 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa18.44■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 RXRAP19793 462 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 GNAQP50148 359 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM189BP81408 668 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 NFXL1Q6ZNB6 911 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF558Q96NG5 402 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 SDF4Q9BRK5 362 aa18.43■□□□□ 0.54
CLEC1B-201ENST00000298527 LY9Q9HBG7 655 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms