RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 POTEB3A0JP26 581 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 POTECB2RU33 542 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 NR3C1P04150 777 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 PLTPP55058 493 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 BASP1P80723 227 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 POTEBQ6S5H4 581 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 EFCAB13Q8IY85 973 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 HDAC11Q96DB2 347 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 PANX2Q96RD6 677 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 A0A0G2JLW4 131 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CYP27A1Q02318 531 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 PROM2Q8N271 834 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SLC16A4O15374 487 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 EFCC1Q9HA90 598 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.82■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 MED4Q9NPJ6 270 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ATP1A3P13637 1013 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ZNF18P17022 549 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 TTC1Q99614 292 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.81■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 UNC13BO14795 1591 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CAMTA2O94983 1202 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 HMGCS2P54868 508 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 PSMC5P62195 406 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 MICALL2Q8IY33 904 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 DENND3A2RUS2 1198 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CXCR5P32302 372 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 GPC4O75487 556 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SLC4A1P02730 911 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ZNF394Q53GI3 561 aa21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 LDHDQ86WU2 507 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 MCUQ8NE86 351 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CIITAP33076 1130 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 USP11P51784 963 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 COASYQ13057 564 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CAPS2Q9BXY5 557 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 HUS1O60921 280 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ZNF699Q32M78 642 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SPATA33Q96N06 139 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 GCLMP48507 274 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 EPHB4P54760 987 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.79■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ASB14A6NK59 587 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 BEST2Q8NFU1 509 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 POTEFA5A3E0 1075 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 POTEIP0CG38 1075 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 LAMC1P11047 1609 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 PSMA2P25787 234 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 EPHB1P54762 984 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CDO1Q16878 200 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 POTEGQ6S5H5 508 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ADAM22Q9P0K1 906 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ASPHQ12797 758 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 KSR1Q8IVT5 923 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 LXNQ9BS40 222 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.78■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 CASP1P29466 404 aa21.77■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 MSH2P43246 934 aa21.77■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
USP25-202ENST00000285681 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms