RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 CTSHP09668 335 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 KLRC1P26715 233 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 MBTPS1Q14703 1052 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 IL17AQ16552 155 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 XKR3Q5GH77 459 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 ANO5Q75V66 913 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 MYLIPQ8WY64 445 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 IL23AQ9NPF7 189 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.6■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 SLITRK3O94933 977 aa23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 DNAJB2P25686 324 aa23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 PKP1Q13835 747 aa23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 LAD1O00515 517 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 CAND2O75155 1236 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 FGBP02675 491 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 PRPHP41219 470 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 MTERF2Q49AM1 385 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 RASIP1Q5U651 963 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 RPAINQ86UA6 219 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.375e-7■□□□□ 8.5
COX5B-201ENST00000258424 C4orf19Q8IY42 314 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 CEP89Q96ST8 783 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.58■■□□□ 1.37
COX5B-201ENST00000258424 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 NBNO60934 754 aa23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 RFC2P35250 354 aa23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 TPH2Q8IWU9 490 aa23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 NEK9Q8TD19 979 aa23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 TIFAQ96CG3 184 aa23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.57■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB39O15060 712 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 MED24O75448 989 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 RSPH10BP0C881 870 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 FOSL2P15408 326 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 MGAT3Q09327 533 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 BECN1Q14457 450 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 FAM26DQ5JW98 314 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 HERVK_113Q902F9 699 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CLIC4Q9Y696 253 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 A0A0C4DFX4 3053 aa23.56■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 LYPLA2O95372 231 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CHRNA1P02708 482 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 NPEPPSP55786 919 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 GRIN2CQ14957 1233 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ZNF576Q9H609 170 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.55■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 PP2D1A8MPX8 630 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CXCL10P02778 98 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CLCN3P51790 818 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 TCTN1Q2MV58 587 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 RSPH3Q86UC2 560 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 METTL13Q8N6R0 699 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.54■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 A0A087WWV3 80 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 MAGEB2O15479 319 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 PDIA5Q14554 519 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 PTPAQ15257 358 aa23.53■■□□□ 1.36
COX5B-201ENST00000258424 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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