RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 CARD6Q9BX69 1037 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 VPS18Q9P253 973 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 MCF2LO15068 1137 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 XKR3Q5GH77 459 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CABS1Q96KC9 395 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ACAD9Q9H845 621 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 RGPD5Q99666 1765 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 CAPN9O14815 690 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 MFAP3LO75121 409 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PDHBP11177 359 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PHKA2P46019 1235 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 IFT81Q8WYA0 676 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 BCS1LQ9Y276 419 aa6.84□□□□□ -1.31
SETX-201ENST00000224140 ZBTB16Q05516 673 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 METTL23Q86XA0 190 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 PIGSQ96S52 555 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 CES2O00748 559 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 CHMP2AO43633 222 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 ATP5HO75947 161 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 TROAPQ12815 778 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.84□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 NR5A1Q13285 461 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 DPP9Q86TI2 863 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 NUP98P52948 1817 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 ZNF543Q08ER8 600 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 KCTD1Q719H9 257 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 KCND1Q9NSA2 647 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 PEAK1Q9H792 1746 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 A0A1B0GTH6 734 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 RMDN3Q96TC7 470 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 KCNK3O14649 394 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 NFIXQ14938 502 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 VPS52Q8N1B4 723 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 GPRASP2Q96D09 838 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 CEP104O60308 925 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 STAT3P40763 770 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 RBL2Q08999 1139 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 APBB2Q92870 758 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 GPC5P78333 572 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 TRIM50Q86XT4 487 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 STMN2Q93045 179 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 FAM212AQ96EL1 285 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 IDI2Q9BXS1 227 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 FCER1AP12319 257 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 SLC12A2P55011 1212 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 MTRQ99707 1265 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 LPXNO60711 386 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 DOK7Q18PE1 504 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 Q4G0T1 1027 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 CCDC38Q502W7 563 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 MYPNQ86TC9 1320 aa6.83□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 TTI1O43156 1089 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 PAMP19021 973 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 CDC27P30260 824 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 PALM2Q8IXS6 379 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 TRIM9Q9C026 710 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.82□□□□□ -1.32
SETX-201ENST00000224140 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms