RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PTPRFP10586 1907 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 DOCK1Q14185 1865 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ADCY6O43306 1168 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 AKAP3O75969 853 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF286BP0CG31 522 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CYP27A1Q02318 531 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PPIL2Q13356 520 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 STIM1Q13586 685 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SARM1Q6SZW1 724 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TC2NQ8N9U0 490 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 RGS22Q8NE09 1264 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 RMND1Q9NWS8 449 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 OTOFQ9HC10 1997 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PHIPQ8WWQ0 1821 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 K7ENM7 598 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CCND2P30279 289 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 KRT9P35527 623 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PRKCEQ02156 737 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ACP6Q9NPH0 428 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 DACH1Q9UI36 760 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.27□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 EYA4O95677 639 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TXNP10599 105 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 OSTNP61366 133 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 MAPK7Q13164 816 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PPP2R5CQ13362 524 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SPRYD7Q5W111 196 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 DLG4P78352 724 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 EPHA7Q15375 998 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CENPPQ6IPU0 288 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 RPTORQ8N122 1335 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CXCL11O14625 94 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TGFB1I1O43294 461 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CAVIN2O95810 425 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SLC9A1P19634 815 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 METTL13Q8N6R0 699 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 NACC1Q96RE7 527 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GTH6 734 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 RASSF10A6NK89 507 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SPAG1Q07617 926 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 KCNB1Q14721 858 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 HINFPQ9BQA5 517 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PARVGQ9HBI0 331 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 WDR64B1ANS9 1081 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TBX3O15119 743 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 DNA2P51530 1060 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 MIIPQ5JXC2 388 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 FIZ1Q96SL8 496 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 PCYT2Q99447 389 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 FGFR4P22455 802 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 CTGFP29279 349 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 EHHADHQ08426 723 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.25□□□□□ -1.25
CNIH1-201ENST00000216416 TBC1D8O95759 1140 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms