RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P SDC1Q03323 175 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P KRE28Q04431 385 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SMA2Q04658 369 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P NAT4Q04751 285 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P DCR2Q05924 578 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P GAS2Q06135 555 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YOL019WQ08157 551 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RDR1Q08904 546 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RCN2Q12044 265 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PSY3Q12318 242 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RPN6Q12377 434 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SWM1Q12379 170 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P NPC2Q12408 173 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MTR10Q99189 972 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YOS9Q99220 542 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SAS5Q99314 248 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ZWF1P11412 505 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MER1P16523 270 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P CTR86P25355 563 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MRE11P32829 692 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P LHP1P33399 275 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P LOT5P34234 306 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TSC10P38342 320 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ARN1P38731 627 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P NSG1P38837 291 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM10P39987 644 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MNN5P46982 586 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MTR3P48240 250 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P COS6P53344 381 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P DBP6P53734 629 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL181WP53878 407 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TIM10P87108 93 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RPM2Q02773 1202 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P NCE101Q02820 53 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P CTL1Q03220 320 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RSN1Q03516 953 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YKU80Q04437 629 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ERB1Q04660 807 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL121CQ07541 149 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P COS7Q07788 383 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YIG1Q08956 461 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P BSC1Q12140 328 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SFG1Q12507 346 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MDM12Q92328 271 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P FAS1P07149 2051 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P FLP1P03870 423 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MRP13P12686 339 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC2P17065 759 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO81P17442 1178 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P EXO70P19658 623 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MDH2P22133 377 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P GAS1P22146 559 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P NFS1P25374 497 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YCL049CP25577 312 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD14P28519 371 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SAC1P32368 623 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YEF1P32622 495 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YPT7P32939 208 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG14P38270 344 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RCK1P38622 512 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ERP5P38819 212 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ALG5P40350 334 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL068CP40363 299 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P QDR2P40474 542 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SMK1P41808 388 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PSA1P41940 361 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MSY1P48527 492 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MON1P53129 644 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RNH70P53331 553 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P ALG12P53730 551 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MTQ1P53944 314 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RNT1Q02555 471 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SWP1Q02795 286 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR476CQ03362 224 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P EKI1Q03764 534 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR249CQ03787 373 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD30Q04049 632 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P SHE9Q04172 456 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P PLM2Q04383 521 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P COX20Q04935 205 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MED2Q12124 431 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P RIB2Q12362 591 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P YPT6Q99260 215 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P CBP6P07253 162 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P MET2P08465 486 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P CBS1P14066 229 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)PtW(CCA)P TFS1P14306 219 aa2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms