RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M SDC1Q03323 175 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M KRE28Q04431 385 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SMA2Q04658 369 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NAT4Q04751 285 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DCR2Q05924 578 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M GAS2Q06135 555 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL019WQ08157 551 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RDR1Q08904 546 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RCN2Q12044 265 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PSY3Q12318 242 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN6Q12377 434 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SWM1Q12379 170 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NPC2Q12408 173 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MTR10Q99189 972 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YOS9Q99220 542 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SAS5Q99314 248 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ZWF1P11412 505 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MER1P16523 270 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CTR86P25355 563 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MRE11P32829 692 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M LHP1P33399 275 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M LOT5P34234 306 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TSC10P38342 320 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ARN1P38731 627 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NSG1P38837 291 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM10P39987 644 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MNN5P46982 586 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MTR3P48240 250 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M COS6P53344 381 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DBP6P53734 629 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL181WP53878 407 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TIM10P87108 93 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RPM2Q02773 1202 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NCE101Q02820 53 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CTL1Q03220 320 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RSN1Q03516 953 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YKU80Q04437 629 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ERB1Q04660 807 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL121CQ07541 149 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M COS7Q07788 383 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YIG1Q08956 461 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BSC1Q12140 328 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SFG1Q12507 346 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MDM12Q92328 271 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M FAS1P07149 2051 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M FLP1P03870 423 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MRP13P12686 339 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC2P17065 759 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO81P17442 1178 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M EXO70P19658 623 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MDH2P22133 377 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M GAS1P22146 559 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NFS1P25374 497 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YCL049CP25577 312 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD14P28519 371 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SAC1P32368 623 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YEF1P32622 495 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YPT7P32939 208 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG14P38270 344 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RCK1P38622 512 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ERP5P38819 212 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ALG5P40350 334 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL068CP40363 299 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M QDR2P40474 542 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SMK1P41808 388 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PSA1P41940 361 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MSY1P48527 492 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MON1P53129 644 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RNH70P53331 553 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ALG12P53730 551 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MTQ1P53944 314 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RNT1Q02555 471 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SWP1Q02795 286 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR476CQ03362 224 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M EKI1Q03764 534 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR249CQ03787 373 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD30Q04049 632 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M SHE9Q04172 456 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M PLM2Q04383 521 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M COX20Q04935 205 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MED2Q12124 431 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RIB2Q12362 591 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YPT6Q99260 215 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CBP6P07253 162 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MET2P08465 486 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M CBS1P14066 229 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TFS1P14306 219 aa2.36□□□□□ -2.03
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