RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K SDC1Q03323 175 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K KRE28Q04431 385 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SMA2Q04658 369 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NAT4Q04751 285 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DCR2Q05924 578 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K GAS2Q06135 555 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YOL019WQ08157 551 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RDR1Q08904 546 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RCN2Q12044 265 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PSY3Q12318 242 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RPN6Q12377 434 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SWM1Q12379 170 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NPC2Q12408 173 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MTR10Q99189 972 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YOS9Q99220 542 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SAS5Q99314 248 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ZWF1P11412 505 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MER1P16523 270 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CTR86P25355 563 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MRE11P32829 692 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K LHP1P33399 275 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K LOT5P34234 306 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TSC10P38342 320 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ARN1P38731 627 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NSG1P38837 291 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM10P39987 644 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MNN5P46982 586 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MTR3P48240 250 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K COS6P53344 381 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DBP6P53734 629 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YNL181WP53878 407 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TIM10P87108 93 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RPM2Q02773 1202 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NCE101Q02820 53 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CTL1Q03220 320 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RSN1Q03516 953 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YKU80Q04437 629 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ERB1Q04660 807 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YDL121CQ07541 149 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K COS7Q07788 383 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YIG1Q08956 461 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K BSC1Q12140 328 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SFG1Q12507 346 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MDM12Q92328 271 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K FAS1P07149 2051 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K FLP1P03870 423 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MRP13P12686 339 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC2P17065 759 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PHO81P17442 1178 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K EXO70P19658 623 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MDH2P22133 377 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K GAS1P22146 559 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NFS1P25374 497 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YCL049CP25577 312 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD14P28519 371 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SAC1P32368 623 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YEF1P32622 495 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YPT7P32939 208 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ATG14P38270 344 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RCK1P38622 512 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ERP5P38819 212 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG5P40350 334 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL068CP40363 299 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K QDR2P40474 542 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SMK1P41808 388 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PSA1P41940 361 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MSY1P48527 492 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MON1P53129 644 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RNH70P53331 553 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K ALG12P53730 551 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MTQ1P53944 314 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RNT1Q02555 471 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SWP1Q02795 286 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR476CQ03362 224 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K EKI1Q03764 534 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YDR249CQ03787 373 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RAD30Q04049 632 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K SHE9Q04172 456 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K PLM2Q04383 521 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K COX20Q04935 205 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MED2Q12124 431 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K RIB2Q12362 591 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K YPT6Q99260 215 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CBP6P07253 162 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K MET2P08465 486 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K CBS1P14066 229 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)KtW(CCA)K TFS1P14306 219 aa2.36□□□□□ -2.03
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