RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J SDC1Q03323 175 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J KRE28Q04431 385 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SMA2Q04658 369 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NAT4Q04751 285 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DCR2Q05924 578 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J GAS2Q06135 555 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL019WQ08157 551 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RDR1Q08904 546 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RCN2Q12044 265 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PSY3Q12318 242 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RPN6Q12377 434 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SWM1Q12379 170 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NPC2Q12408 173 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MTR10Q99189 972 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YOS9Q99220 542 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SAS5Q99314 248 aa2.39□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ZWF1P11412 505 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MER1P16523 270 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CTR86P25355 563 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MRE11P32829 692 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J LHP1P33399 275 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J LOT5P34234 306 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TSC10P38342 320 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ARN1P38731 627 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NSG1P38837 291 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM10P39987 644 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MNN5P46982 586 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MTR3P48240 250 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J COS6P53344 381 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP6P53734 629 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL181WP53878 407 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM10P87108 93 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RPM2Q02773 1202 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NCE101Q02820 53 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CTL1Q03220 320 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RSN1Q03516 953 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YKU80Q04437 629 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ERB1Q04660 807 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL121CQ07541 149 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J COS7Q07788 383 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YIG1Q08956 461 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BSC1Q12140 328 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SFG1Q12507 346 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MDM12Q92328 271 aa2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J FAS1P07149 2051 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MF(ALPHA)1P01149 165 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J FLP1P03870 423 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP13P12686 339 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC2P17065 759 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO81P17442 1178 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J EXO70P19658 623 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MDH2P22133 377 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J GAS1P22146 559 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NFS1P25374 497 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YCL049CP25577 312 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD14P28519 371 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SAC1P32368 623 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YEF1P32622 495 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YPT7P32939 208 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG14P38270 344 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RCK1P38622 512 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ERP5P38819 212 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG5P40350 334 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL068CP40363 299 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J QDR2P40474 542 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SMK1P41808 388 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PSA1P41940 361 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MSY1P48527 492 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MON1P53129 644 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RNH70P53331 553 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ALG12P53730 551 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MTQ1P53944 314 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RNT1Q02555 471 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SWP1Q02795 286 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR476CQ03362 224 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J EKI1Q03764 534 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR249CQ03787 373 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD30Q04049 632 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J SHE9Q04172 456 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J PLM2Q04383 521 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J COX20Q04935 205 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MED2Q12124 431 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RIB2Q12362 591 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YPT6Q99260 215 aa2.37□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CBP6P07253 162 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MET2P08465 486 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J CBS1P14066 229 aa2.36□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TFS1P14306 219 aa2.36□□□□□ -2.03
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