RNA–Protein interactions for RNA: YKL214C

YRA2, Transcript of Member of the REF (RNA and export factor binding proteins) family, yeast

Gene YRA2, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRA2	YKL214C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YSC83	P32792	385 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RIB1	P38066	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MIC12	P38341	106 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MSS4	P38994	779 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SOK1	P40317	901 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	STE24	P47154	453 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	STB4	P50104	949 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RRN9	P53437	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MRS2	Q01926	470 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FMP30	Q02883	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	COQ9	Q05779	260 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	COQ11	Q05892	277 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	DCR2	Q05924	578 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ARR3	Q06598	404 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YFT2	Q06676	274 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	REX4	Q08237	289 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	COX1	P00401	534 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	GAL10	P04397	699 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CHS1	P08004	1131 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SPE1	P08432	466 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ADE1	P27616	306 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PEX3	P28795	441 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RPC34	P32910	317 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	COS9	P36034	407 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CHK1	P38147	527 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	DUG2	P38149	878 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	QDR3	P38227	689 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	GET2	P40056	285 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	GAB1	P41733	394 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SPG5	P42933	373 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YRA2	YKL214C	NPA3	P47122	385 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YGL108C	P53139	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SHR3	Q02774	210 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	POS5	Q06892	414 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CYK3	Q07533	885 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TEN1	Q07921	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TRM11	Q12463	433 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RMD5	Q12508	421 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	REV1	P12689	985 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	CKI1	P20485	582 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	DAL82	P21705	255 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	LHS1	P36016	881 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	GMH1	P36125	273 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	SIC1	P38634	284 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FHL1	P39521	936 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ELO1	P39540	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YJL163C	P46996	555 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YGR168C	P53293	376 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	NRG1	Q03125	231 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	IZH1	Q03419	316 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	FAR8	Q05040	523 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	TPO1	Q07824	586 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
YRA2	YKL214C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RGS2	Q99188	309 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	COX2	P00410	251 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	COX3	P00420	269 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	HTB2	P02294	131 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	RHO2	P06781	192 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	QCR2	P07257	368 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	MAS2	P11914	482 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YRA2	YKL214C	WHI2	P12611	486 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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