RNA–Protein interactions for RNA: YJL209W

CBP1, Transcript of Mitochondrial protein, regulator of COB mRNA stability and translation, yeast

Gene CBP1, Length 1,965 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBP1	YJL209W	CSM1	P25651	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	AIM29	P36154	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	CBP4	P37267	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SLX1	P38324	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YMR262W	P38430	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SOL4	P53315	255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	UBX2	Q04228	584 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	ASA1	Q06822	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	VAM7	P32912	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	MRPS5	P33759	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	ORC5	P50874	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	BIO4	P53630	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	HXT11	P54862	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	GIS1	Q03833	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	AIM39	Q08223	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	RGS2	Q99188	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	CLN3	P13365	580 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YPK2	P18961	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	BUB3	P26449	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YPK3	P38070	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	ARN1	P38731	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YGR168C	P53293	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SLT2	Q00772	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	NAT4	Q04751	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	APC2	Q12440	853 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	UTR1	P21373	530 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	APA2	P22108	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	RRT12	P25381	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YKL071W	P36086	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YHR182W	P38870	785 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	PCP1	P53259	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
CBP1	YJL209W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	KIN3	P22209	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	FLO10	P36170	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SLM1	P40485	686 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	NAS6	P50086	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	RRN9	P53437	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	TMN2	Q04562	672 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	DIC1	Q06143	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	GMC2	Q06201	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	PAM18	Q07914	168 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	GET4	Q12125	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SIA1	Q12212	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	ORT1	Q12375	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	RAD1	P06777	1100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	KSS1	P14681	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SNC1	P31109	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	LIP5	P32875	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	MYO3	P36006	1272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	HIS2	P38635	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	BIG1	P38813	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SHO1	P40073	367 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	HMS2	P47175	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	GPI1	P53306	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	ESBP6	P53918	673 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	BET4	Q00618	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	PNG1	Q02890	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SLD5	Q03406	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CBP1	YJL209W	HEM2	P05373	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	FAR1	P21268	830 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	YCR007C	P25354	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	PBN1	P25580	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	MMS21	P38632	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	LEU5	P38702	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	NUP100	Q02629	959 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	MUK1	Q02866	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	GRS2	Q06817	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	SPO12	P17123	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	MAL32	P38158	584 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	MRX5	P47007	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	MAL12	P53341	584 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CBP1	YJL209W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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