RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 BMPR1AP36894 532 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CEP55Q53EZ4 464 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 PGBD1Q96JS3 809 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 PCYT2Q99447 389 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.15■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 ESYT2A0FGR8 921 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 MBTPS2O43462 519 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 APOBRQ0VD83 1088 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 HYAL1Q12794 435 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 GRIK4Q16099 956 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 Q6ZUG5 572 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.14■■□□□ 1.62
SRRT-218ENST00000620394 GRM6O15303 877 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 TBX10O75333 385 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 MMP1P03956 469 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 SCG2P13521 617 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 MARK3P27448 753 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 ADD1P35611 737 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 FGD1P98174 961 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 MGAT3Q09327 533 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 RUFY4Q6ZNE9 571 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 GLG1Q92896 1179 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 BRF1Q92994 677 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 TTC3P53804 2025 aa25.13■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 MEIS1O00470 390 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 REC8O95072 547 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 CHRNA1P02708 482 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 GHRP10912 638 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 RPS6KB1P23443 525 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 CLUL1Q15846 466 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 SDF4Q9BRK5 362 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 PLVAPQ9BX97 442 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 TMEM260Q9NX78 707 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 MUTYHQ9UIF7 546 aa25.12■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 ARP10275 920 aa25.11■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 ACTR2P61160 394 aa25.11■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.11■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.11■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 CD207Q9UJ71 328 aa25.11■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 EVCP57679 992 aa25.1■■□□□ 1.61
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SRRT-218ENST00000620394 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.1■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.09■■□□□ 1.61
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SRRT-218ENST00000620394 ATG7O95352 703 aa25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 CYP3A4P08684 503 aa25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 LPIN1Q14693 890 aa25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 NTRK3Q16288 839 aa25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 RNF135Q8IUD6 432 aa25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 AZI2Q9H6S1 392 aa25.09■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 TECTAO75443 2155 aa25.09■■□□□ 1.61
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SRRT-218ENST00000620394 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.08■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 FAM86B1E9PN63 330 aa25.08■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.08■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 INSRRP14616 1297 aa25.08■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 PSMA5P28066 241 aa25.08■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 MCTP2Q6DN12 878 aa25.08■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 P2RX5Q93086 422 aa25.08■■□□□ 1.61
SRRT-218ENST00000620394 WDR81Q562E7 1941 aa25.08■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 PLCB4Q15147 1175 aa25.07■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.07■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 DNAJB3Q8WWF6 145 aa25.07■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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SRRT-218ENST00000620394 ADAMTS3O15072 1205 aa25.06■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 DGKIO75912 1065 aa25.06■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 CSPG5O95196 566 aa25.06■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 CCNE2O96020 404 aa25.06■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 NDUFV1P49821 464 aa25.06■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 SLC26A2P50443 739 aa25.06■■□□□ 1.6
SRRT-218ENST00000620394 STAT5BP51692 787 aa25.06■■□□□ 1.6
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SRRT-218ENST00000620394 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa25.06■■□□□ 1.6
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