RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 PSAPP07602 524 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 CTSHP09668 335 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 INSRRP14616 1297 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 KRT2P35908 639 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 KCNJ6P48051 423 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 TRIM29Q14134 588 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 MBTPS1Q14703 1052 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 RABEP1Q15276 862 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 INF2Q27J81 1249 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 FAM26DQ5JW98 314 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 MARCH8Q5T0T0 291 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 LRCH2Q5VUJ6 765 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 POTEBQ6S5H4 581 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 ATP8B4Q8TF62 1192 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SLC5A5Q92911 643 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 GUCD1Q96NT3 240 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 TEKT3Q9BXF9 490 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SEMA6BQ9H3T3 888 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 METRNQ9UJH8 293 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 COL1A2P08123 1366 aa12.5□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 JAK2O60674 1132 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SFNP31947 248 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PBX2P40425 430 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 JAK3P52333 1124 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 WDR5P61964 334 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 IGBP1P78318 339 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 ST3GAL1Q11201 340 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 IKBKEQ14164 716 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 LETM2Q2VYF4 491 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SWSAP1Q6NVH7 229 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 RUFY4Q6ZNE9 571 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 NEK8Q86SG6 692 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 RDM1Q8NG50 284 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 FAM167AQ96KS9 214 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 FAM161BQ96MY7 647 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 UIMC1Q96RL1 719 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 GJB4Q9NTQ9 266 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SAMM50Q9Y512 469 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 MICAL3Q7RTP6 2002 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 WDR81Q562E7 1941 aa12.49□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SIP14410 1827 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 DTNBO60941 627 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PSMD10O75832 226 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 MMP1P03956 469 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 MGAT3Q09327 533 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF484Q5JVG2 852 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 HERC6Q8IVU3 1022 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 ETNPPLQ8TBG4 499 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 OXER1Q8TDS5 423 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SEPT8Q92599 483 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 APBB2Q92870 758 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF576Q9H609 170 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 DISC1Q9NRI5 854 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 GABBR1Q9UBS5 961 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 PTPRSQ13332 1948 aa12.48□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 KIF28PB7ZC32 967 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 CHMP2AO43633 222 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SLC37A4O43826 429 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 ST18O60284 1047 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 RABGGTBP53611 331 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 NR5A1Q13285 461 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 TCTN1Q2MV58 587 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 KRT40Q6A162 431 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 DNAJB3Q8WWF6 145 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 TNFRSF25Q93038 417 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 FAM20AQ96MK3 541 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 UNC45AQ9H3U1 944 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 SLC28A3Q9HAS3 691 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 KCNMB3Q9NPA1 279 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 CEP131Q9UPN4 1083 aa12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 M0QZ92 97 aa12.46□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 TBX3O15119 743 aa12.46□□□□□ -0.41
UBXN8-209ENST00000620074 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms