RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 LRRD1A4D1F6 860 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 BASP1P80723 227 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDP1-208ENST00000613122 TSPY1Q01534 308 aa21.77■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SEPT6Q14141 434 aa21.77■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L15C9J2P7 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L11C9JVI0 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L18D6R9N7 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L22D6RA61 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L19D6RCP7 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L20D6RJB6 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SFNP31947 248 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L24Q0WX57 530 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 MMEL1Q495T6 779 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 PADI6Q6TGC4 694 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 FDX1P10109 184 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SLC35F6Q8N357 371 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 NDST4Q9H3R1 872 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 HUS1O60921 280 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 BEST2Q8NFU1 509 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CERKQ8TCT0 537 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 TTC36A6NLP5 189 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ENC1O14682 589 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 FAM20AQ96MK3 541 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 GNGT1P63211 74 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 RESTQ13127 1097 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 NEK9Q8TD19 979 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SCINQ9Y6U3 715 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ZBED6P86452 979 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CUL4AQ13619 759 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 F5H6K3 240 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 KLRC3Q07444 240 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 DPYSL4O14531 572 aa21.74■■□□□ 1.07
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CTDP1-208ENST00000613122 GRM4Q14833 912 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CDO1Q16878 200 aa21.74■■□□□ 1.07
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CTDP1-208ENST00000613122 CHRNA5P30532 468 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 TMTC4Q5T4D3 741 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 CPVLQ9H3G5 476 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 TLK1Q9UKI8 766 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 UNC13DQ70J99 1090 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 DYDC2Q96IM9 177 aa21.74■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 NMT2O60551 498 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 STAT3P40763 770 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 IRX4P78413 519 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 APBA1Q02410 837 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 DONSONQ9NYP3 566 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 FAM8A1Q9UBU6 413 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 HSPA6P17066 643 aa21.73■■□□□ 1.07
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CTDP1-208ENST00000613122 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
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CTDP1-208ENST00000613122 GPC3P51654 580 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 STX1BP61266 288 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 KSR1Q8IVT5 923 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.73■■□□□ 1.07
CTDP1-208ENST00000613122 PSMA2P25787 234 aa21.73■■□□□ 1.07
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