RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 USH1GQ495M9 461 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 GALNT17Q6IS24 598 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CAGE1Q8TC20 777 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PIGSQ96S52 555 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TTC3P53804 2025 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 AKAP13Q12802 2813 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 EFCAB14O75071 495 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SELPP16109 830 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PDCP20941 246 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CDC27P30260 824 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ME3Q16798 604 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SUSD6Q92537 303 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 TMX3Q96JJ7 454 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 C6orf50Q9HD87 102 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 BARHL2Q9NY43 387 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.9□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ESYT2A0FGR8 921 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GRM6O15303 877 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CYTH3O43739 400 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GLP2RO95838 553 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 POLR2MP0CAP2 368 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ADCY7P51828 1080 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NSMFQ6X4W1 530 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 DNERQ8NFT8 737 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 MORC4Q8TE76 937 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PHKBQ93100 1093 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ASB14A6NK59 587 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NLRP5P59047 1200 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 FUT2Q10981 343 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 AP3B2Q13367 1082 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 IKBKEQ14164 716 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NTRK3Q16288 839 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 NECAB1Q8N987 351 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CPVLQ9H3G5 476 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 MYH6P13533 1939 aa8.88□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SMCO2A6NFE2 343 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 H3BQV1 296 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PIK3CDO00329 1044 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 STAM2O75886 525 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 BRD1O95696 1058 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CFBP00751 764 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 ADRB1P08588 477 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CKBP12277 381 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 CLCN5P51795 746 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SNAP25P60880 206 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GHRHRQ02643 423 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 PTGISQ16647 500 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 XRRA1Q6P2D8 792 aa8.87□□□□□ -0.99
ZNF548-208ENST00000597576 SESTD1Q86VW0 696 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms