RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 PADI6Q6TGC4 694 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SFR1Q86XK3 245 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 VSTM4Q8IW00 320 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 PLXNB2O15031 1838 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR81Q562E7 1941 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 STBD1O95210 358 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 INHBEP58166 350 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR78Q5VTH9 848 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNJ18B7U540 433 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM13AO94988 1023 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 RSPH10BP0C881 870 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNJ12Q14500 433 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT31Q15323 416 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC41Q15345 812 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 TSG101Q99816 390 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPK4P31152 587 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 GSDMDP57764 484 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPK7Q13164 816 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 PARVGQ9HBI0 331 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ESPNB1AK53 854 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.635e-10■■■□□ 17.3
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF3CO14782 793 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 PTGS1P23219 599 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ADORA2AP29274 412 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 GRB14Q14449 540 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL7BQ6UX53 244 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 OTUD6AQ7L8S5 288 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE4BO95155 1302 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF862O60290 1169 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PBX1P40424 430 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TMC6Q7Z403 805 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR142Q7Z601 462 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 DAW1Q8N136 415 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC102AQ96A19 550 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 FIZ1Q96SL8 496 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 BACH1O14867 736 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 HIP1RO75146 1068 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.19■■□□□ 1.62
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