RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585236.5

TSPOAP1-AS1-211, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NUP58Q9BVL2 599 aa29.24■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NDST4Q9H3R1 872 aa29.24■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MYBP10242 640 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 GUCY2CP25092 1073 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SFNP31947 248 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ZNF131P52739 623 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SYCP1Q15431 976 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RETREG2Q8NC44 543 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PARVGQ9HBI0 331 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa29.23■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TTC26A0AVF1 554 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 STAM2O75886 525 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRT9P35527 623 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PPIL2Q13356 520 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 POLD4Q9HCU8 107 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 BTBD7Q9P203 1132 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SEL1LQ9UBV2 794 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CAPN11Q9UMQ6 739 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa29.22■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SFI1A8K8P3 1242 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 WDR64B1ANS9 1081 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 GCNT3O95395 438 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HOXD13P35453 343 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MARSP56192 900 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MYCT1Q8N699 235 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FBXO40Q9UH90 709 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LCTP09848 1927 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SOWAHDA6NJG2 315 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PDXKO00764 312 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CCNE2O96020 404 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CCDC40Q4G0X9 1142 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 REXO1L1PQ8IX06 675 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RDM1Q8NG50 284 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TTYH3Q9C0H2 523 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PADI6Q6TGC4 694 aa29.2■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.2■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SENP7Q9BQF6 1050 aa29.2■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RGS20O76081 388 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ADAM9Q13443 819 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FIGNQ5HY92 759 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TMTC1Q8IUR5 882 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 C4orf19Q8IY42 314 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 DNERQ8NFT8 737 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 IQCDQ96DY2 449 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CDHR1Q96JP9 859 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 IWS1Q96ST2 819 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PFASO15067 1338 aa29.19■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RASSF10A6NK89 507 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CETN3O15182 167 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CALUO43852 315 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TUBB4AP04350 444 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 C1QTNF8P60827 252 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PSMC5P62195 406 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MTF1Q14872 753 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RAD9BQ6WBX8 426 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 DNAJC7Q99615 494 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KCNA2P16389 499 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KLK7P49862 253 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CHADLQ6NUI6 762 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 OR8K1Q8NGG5 319 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FIZ1Q96SL8 496 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.18■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PEX10O60683 326 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NR2F2P24468 414 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 YWHABP31946 246 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RARRES1P49788 294 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 UGCGQ16739 394 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 GNPTABQ3T906 1256 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CYP26C1Q6V0L0 522 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MYRIPQ8NFW9 859 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 OPTNQ96CV9 577 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SIK3Q9Y2K2 1263 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NFASCO94856 1347 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 UBE4BO95155 1302 aa29.17■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NMT1P30419 496 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms