RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 INTUQ9ULD6 942 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 NEDD4P46934 1319 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PSAPP07602 524 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 IQCB1Q15051 598 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 METTL23Q86XA0 190 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 KDM6BO15054 1643 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TTI1O43156 1089 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SFI1A8K8P3 1242 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ALCAMQ13740 583 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ZWILCHQ9H900 591 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 UNC13DQ70J99 1090 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 DPP9Q86TI2 863 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CEP72Q9P209 647 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PPME1Q9Y570 386 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CA4P22748 312 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TMC4Q7Z404 712 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CDHR1Q96JP9 859 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A1P02730 911 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP1Q9C000 1473 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 MAPK13O15264 365 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CASP1P29466 404 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 HSPH1Q92598 858 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 GSTA4O15217 222 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 BBOX1O75936 387 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC188H7C350 402 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 EFHD1Q9BUP0 239 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 LGALS16A8MUM7 142 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ART3Q13508 389 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 MYO1EQ12965 1108 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ATG16L1Q676U5 607 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CEP70Q8NHQ1 597 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PODXLO00592 558 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CFLARO15519 480 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ZBED1O96006 694 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 MMEP08473 750 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PDCLQ13371 301 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF233A6NK53 670 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 ADAM21Q9UKJ8 722 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 NEO1Q92859 1461 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC53A6NM62 1247 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 KRT80Q6KB66 452 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PDIK1LQ8N165 341 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 STK36Q9NRP7 1315 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 H7C1W4 665 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 PRR29P0C7W0 189 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPP22059 807 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRM-211ENST00000580170 GGCXP38435 758 aa22.91■■□□□ 1.26
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