RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FAM26DQ5JW98 314 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CTR9Q6PD62 1173 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TLK2Q86UE8 772 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 ATCAYQ86WG3 371 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM199Q8N511 208 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 FAM133AQ8N9E0 248 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PANK1Q8TE04 598 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 DDX11Q96FC9 970 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CCDC17Q96LX7 622 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 HIPK3Q9H422 1215 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PAG1Q9NWQ8 432 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MSRAQ9UJ68 235 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 POLIQ9UNA4 740 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 MTCH2Q9Y6C9 303 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-206ENST00000578093 CFAP54Q96N23 3096 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.71□□□□□ -1.65
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PTPRM-206ENST00000578093 LCHNA4D1U4 455 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-206ENST00000578093 ATP2A1O14983 1001 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 ITGA7Q13683 1181 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 C8orf34Q49A92 452 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 EEPD1Q7L9B9 569 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-206ENST00000578093 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 RNF146Q9NTX7 359 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-206ENST00000578093 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-206ENST00000578093 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 LAMA4Q16363 1823 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 M0R2C6 588 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 LPXNO60711 386 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRM-206ENST00000578093 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
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