RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 EDNRBP24530 442 aa32.22■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF131P52739 623 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBXN1Q04323 297 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 BMT2Q1RMZ1 405 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 Q3C1V9 767 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPFIBP1Q86W92 1011 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD10Q9H3F6 313 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC9A2Q9UBY0 812 aa32.21■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOWAHBA6NEL2 793 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 CELF2O95319 508 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 YWHABP31946 246 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PADI6Q6TGC4 694 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC55Q6ZSA7 311 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYCT1Q8N699 235 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 MS4A4AQ96JQ5 239 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP63Q96MT8 703 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKEF1Q9NU02 776 aa32.2■■■□□ 2.75
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PQC6 194 aa32.2■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RARRES1P49788 294 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERVK-9P63128 1117 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERVK-24P63145 666 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM14Q14142 442 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD2Q14681 263 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 EDRF1Q3B7T1 1238 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 NELFCDQ8IXH7 590 aa32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 WDR81Q562E7 1941 aa32.19■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF507Q8TCN5 953 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMP19Q99542 508 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIPINQ9BVW5 301 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMX1Q9H3N1 280 aa32.19■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYH11P35749 1972 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNJ6P48051 423 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCL15Q16663 113 aa32.18■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP6V0A1Q93050 837 aa32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CASP5P51878 434 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 UGCGQ16739 394 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD23Q86SG2 305 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TC2NQ8N9U0 490 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBE4BO95155 1302 aa32.17■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 EEF2KMTQ96G04 330 aa32.17■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC37A2A6NM11 1700 aa32.16■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MYBP10242 640 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCNA1P78396 465 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa32.16■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa32.15■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 SFI1A8K8P3 1242 aa32.15■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HIP1RO75146 1068 aa32.14■■■□□ 2.74
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TGFB3P10600 412 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADKP55263 362 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIIPQ5JXC2 388 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 FKBP15Q5T1M5 1219 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPRYD7Q5W111 196 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABHD15Q6UXT9 468 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRI3BPQ8WY22 251 aa32.14■■■□□ 2.74
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC51Q96ER9 411 aa32.14■■■□□ 2.74
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