RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 KIF3CO14782 793 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 PGK2P07205 417 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 FCER1AP12319 257 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 CYP11B2P19099 503 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 CCNA1P78396 465 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 ZSCAN26Q16670 478 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 RGMBQ6NW40 437 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 SARM1Q6SZW1 724 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 GOLGA5Q8TBA6 731 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 DRC1Q96MC2 740 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 PRCPP42785 496 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 GPBP1Q86WP2 473 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 NEK9Q8TD19 979 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 TRIM5Q9C035 493 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 MORF4L1Q9UBU8 362 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 EYA4O95677 639 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 KCNA2P16389 499 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 STK4Q13043 487 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 ARSHQ5FYA8 562 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 PIGOQ8TEQ8 1089 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 LXNQ9BS40 222 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 BHMT2Q9H2M3 363 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 FANCLQ9NW38 375 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 SAMM50Q9Y512 469 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 P4HBP07237 508 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 IDEP14735 1019 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 KRT76Q01546 638 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 ADSSL1Q8N142 457 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 SGSM3Q96HU1 749 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 FGD4Q96M96 766 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 ST7Q9NRC1 585 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 ZBTB39O15060 712 aa19.58■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 CCNE2O96020 404 aa19.58■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 TNNT1P13805 278 aa19.58■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 ICAM3P32942 547 aa19.58■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 STX17P56962 302 aa19.58■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 NACC1Q96RE7 527 aa19.58■□□□□ 0.73
GDE1-203ENST00000564172 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 EHHADHQ08426 723 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 HPS3Q969F9 1004 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 BCAS3Q9H6U6 928 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 PSD3Q9NYI0 1048 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 LCMT1Q9UIC8 334 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 NFASCO94856 1347 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 WDR64B1ANS9 1081 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 B4DLN1 442 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SFNP31947 248 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 ZNF75DP51815 510 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 JAK3P52333 1124 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 PAK1Q13153 545 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 CTNND2Q9UQB3 1225 aa19.57■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 ATP1A3P13637 1013 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SPATA1Q5VX52 437 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 KIAA0895Q8NCT3 520 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SENP7Q9BQF6 1050 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 PANK4Q9NVE7 773 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 RWDD2AQ9UIY3 292 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 TLL2Q9Y6L7 1015 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SSR1P43307 286 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 QARSP47897 775 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SP2Q02086 613 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 STIM1Q13586 685 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 RDM1Q8NG50 284 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 NELFBQ8WX92 580 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SLC39A2Q9NP94 309 aa19.56■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 ATP8B1O43520 1251 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 KRT18P05783 430 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 SLC10A3P09131 477 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 COASYQ13057 564 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 PSMD2Q13200 908 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 GIT2Q14161 759 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 FAM110CQ1W6H9 321 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 COBLL1Q53SF7 1204 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 CCDC65Q8IXS2 484 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 FHOD1Q9Y613 1164 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 TTC36A6NLP5 189 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 ZNF18P17022 549 aa19.55■□□□□ 0.72
GDE1-203ENST00000564172 RINT1Q6NUQ1 792 aa19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms