RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM199Q8N511 208 aa21.22■□□□□ 0.99
RABGGTA-208ENST00000558954 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
RABGGTA-208ENST00000558954 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.22■□□□□ 0.99
RABGGTA-208ENST00000558954 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
RABGGTA-208ENST00000558954 OATP04181 439 aa21.21■□□□□ 0.99
RABGGTA-208ENST00000558954 IGBP1P78318 339 aa21.21■□□□□ 0.99
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.21■□□□□ 0.99
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RABGGTA-208ENST00000558954 PSMC5P62195 406 aa21.2■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.2■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 POTEMA6NI47 508 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 WNT8BQ93098 351 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 LXNQ9BS40 222 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.19■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 CKBP12277 381 aa21.18■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 SELPP16109 830 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 THPOP40225 353 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 PRPHP41219 470 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 RESTQ13127 1097 aa21.18■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 XKR3Q5GH77 459 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC8DQ7L1W4 858 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 RSPH3Q86UC2 560 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB34Q9BZG1 259 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 PRO3102Q9H379 93 aa21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP4A11Q02928 519 aa21.17■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 ERMNQ8TAM6 284 aa21.17■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 GBF1Q92538 1859 aa21.17■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 SCLYQ96I15 445 aa21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 DYDC2Q96IM9 177 aa21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.16■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 KLRC1P26715 233 aa21.15■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.15■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 C4orf19Q8IY42 314 aa21.15■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 RGL1Q9NZL6 768 aa21.15■□□□□ 0.98
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RABGGTA-208ENST00000558954 C22orf31O95567 290 aa21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-208ENST00000558954 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-208ENST00000558954 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-208ENST00000558954 TPH2Q8IWU9 490 aa21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-208ENST00000558954 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-208ENST00000558954 TDHQ8IZJ6 230 aa21.14■□□□□ 0.97
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.14■□□□□ 0.97
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