RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 CTSHP09668 335 aa23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 MBTPS1Q14703 1052 aa23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 UGCGQ16739 394 aa23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.371e-6■□□□□ 8.2
TMOD3-203ENST00000558455 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF862O60290 1169 aa23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 MARCH6O60337 910 aa23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 NEMFO60524 1076 aa23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 RSPH10BP0C881 870 aa23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 ATP2B1P20020 1258 aa23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 PPP2R5CQ13362 524 aa23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TMOD3-203ENST00000558455 KAT6AQ92794 2004 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 COL1A2P08123 1366 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 EML1O00423 815 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 CXCL10P02778 98 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 PRKCEQ02156 737 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 CUL4AQ13619 759 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 CALCRLQ16602 461 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 RPAINQ86UA6 219 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 FAM167AQ96KS9 214 aa23.57■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 OATP04181 439 aa23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 ACTN1P12814 892 aa23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 RSPH3Q86UC2 560 aa23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.56■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 ZBBXA8MT70 800 aa23.55■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 KLRC1P26715 233 aa23.55■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 MCM7P33993 719 aa23.55■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.55■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 TET1Q8NFU7 2136 aa23.55■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 SZT2Q5T011 3432 aa23.55■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 CHRNA1P02708 482 aa23.54■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 FAM26DQ5JW98 314 aa23.54■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 BANK1Q8NDB2 785 aa23.54■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.54■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.54■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.54■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 C22orf31O95567 290 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 TCTN1Q2MV58 587 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 TTC38Q5R3I4 469 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 MCTP1Q6DN14 999 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 MTMR9Q96QG7 549 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.53■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 H3BQV1 296 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 BAIAP3O94812 1187 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 TXKP42681 527 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 TRAPPC10P48553 1259 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 MGAT3Q09327 533 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF174Q15697 407 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 GPR153Q6NV75 609 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.52■■□□□ 1.36
TMOD3-203ENST00000558455 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 STBD1O95210 358 aa23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 PSMC5P62195 406 aa23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 NBR1Q14596 966 aa23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 EPHA7Q15375 998 aa23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 XKR3Q5GH77 459 aa23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 WDR81Q562E7 1941 aa23.51■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM150BA6NC51 233 aa23.5■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.5■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.5■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.5■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.5■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TMOD3-203ENST00000558455 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms