RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555668.5

GPHN-210, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-210	ENST00000555668	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	KIF15	Q9NS87	1388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	KIF3B	O15066	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	IDO1	P14902	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	GLDC	P23378	1020 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	MCM3	P25205	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ST5	P78524	1137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668		Q4G0T1	1027 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ATP10A	O60312	1499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ERICH2	A1L162	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	KDM1A	O60341	852 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	NEMF	O60524	1076 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PEX10	O60683	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	BBOX1	O75936	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SLC8A1	P32418	973 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PDE6B	P35913	854 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	HDAC4	P56524	1084 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	CUL3	Q13618	768 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	KCNA10	Q16322	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	FXN	Q16595	210 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	SPON2	Q9BUD6	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GPHN-210	ENST00000555668	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms