RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 TNFRSF25Q93038 417 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 NCK2O43639 380 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 BMP15O95972 392 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 IER5LQ5T953 404 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 PANK2Q9BZ23 570 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 CLDND1Q9NY35 253 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 C5orf42Q9H799 3197 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 KLRF2D3W0D1 207 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 NFIBO00712 420 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 EDNRBP24530 442 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 NR5A1Q13285 461 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 GPM6BQ13491 265 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 OXER1Q8TDS5 423 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 KINO60870 393 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 AMHP03971 560 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 LTBRP36941 435 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 TRAPPC10P48553 1259 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF135Q8IUD6 432 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 CYTH3O43739 400 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 LGR5O75473 907 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 PDHBP11177 359 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 NLRP5P59047 1200 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 TCF15Q12870 199 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 KAT2BQ92831 832 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 TIGD1Q96MW7 591 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDSP2-204ENST00000548823 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 GFRA3O60609 400 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 CAVIN2O95810 425 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MMP3P08254 477 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 PTK7Q13308 1070 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 RPAINQ86UA6 219 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 DNERQ8NFT8 737 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 AFG1LQ8WV93 481 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 BARHL2Q9NY43 387 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO7AQ13402 2215 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 B4DLN1 442 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ARIH2O95376 493 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM192Q8IY95 271 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 HPSEQ9Y251 543 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM221A6NGB7 291 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 M0R296 226 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MBTPS2O43462 519 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MBTPS1Q14703 1052 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 RESP18Q5W5W9 173 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO11Q86XK2 927 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 BLIDQ8IZY5 108 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 C7orf31Q8N865 590 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 EMSYQ7Z589 1322 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 NDUFA8P51970 172 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 TYRO3Q06418 890 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 CAMK4Q16566 473 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-204ENST00000548823 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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