RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548465.1

TPCN1-211, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 3

Gene TPCN1, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-211ENST00000548465 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TPCN1-211ENST00000548465 PTPRSQ13332 1948 aa14.96□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 WDR64B1ANS9 1081 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 CHRNA1P02708 482 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MYOGP15173 224 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 DNAJB2P25686 324 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 GPR153Q6NV75 609 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 PBX4Q9BYU1 374 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.95□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 EML1O00423 815 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 HBP1O60381 514 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 KLRC1P26715 233 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SLC26A2P50443 739 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 DEFB103AP81534 67 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MGAT3Q09327 533 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 FAM26DQ5JW98 314 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 VAV3Q9UKW4 847 aa14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 TMEM150BA6NC51 233 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 KIF28PB7ZC32 967 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 CAND2O75155 1236 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 ACTN1P12814 892 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 JAK3P52333 1124 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.93□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 STBD1O95210 358 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 GHRP10912 638 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 ATP2B1P20020 1258 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SFNP31947 248 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 PRKCEQ02156 737 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 RPAINQ86UA6 219 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 BANK1Q8NDB2 785 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 FAM20AQ96MK3 541 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 GUCD1Q96NT3 240 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.92□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 COL1A2P08123 1366 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 BAIAP3O94812 1187 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 ARHGEF15O94989 841 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 C22orf31O95567 290 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 OATP04181 439 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 PPP2R5CQ13362 524 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 LPIN1Q14693 890 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 TIFAQ96CG3 184 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 TBX3O15119 743 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MCM7P33993 719 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 IKBKEQ14164 716 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 NBR1Q14596 966 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 RSPH3Q86UC2 560 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 RDM1Q8NG50 284 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 EVPLQ92817 2033 aa14.9□□□□□ -0.02
TPCN1-211ENST00000548465 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms