RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 DEXIO95424 95 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 CIITAP33076 1130 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 KRT76Q01546 638 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 LPIN1Q14693 890 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SAMD11Q96NU1 681 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SQORQ9Y6N5 450 aa22.95■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 KAT6AQ92794 2004 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 PSAPP07602 524 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 USP11P51784 963 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 UIMC1Q96RL1 719 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SAMM50Q9Y512 469 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.94■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 ADAMTS3O15072 1205 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 CDKL5O76039 1030 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 KLRC1P26715 233 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 STK3Q13188 491 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 KRT40Q6A162 431 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SPRED2Q7Z698 418 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 IL17RAQ96F46 866 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 COG5Q9UP83 839 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.93■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 COL1A2P08123 1366 aa22.92■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 LPXNO60711 386 aa22.92■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 GALNT17Q6IS24 598 aa22.92■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.92■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 ENPP3O14638 875 aa22.91■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.91■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.91■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.91■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 WDR64B1ANS9 1081 aa22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 CD52P31358 61 aa22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 PAK2Q13177 524 aa22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 PTPROQ16827 1216 aa22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 BLIDQ8IZY5 108 aa22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 FIBCD1Q8N539 461 aa22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 HLA-CQ95604 372 aa22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
DDB1-220ENST00000542337 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 GAS7O60861 476 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 XBP1P17861 261 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 ANAPC15P60006 121 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 ANKRD1Q15327 319 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 EPC2Q52LR7 807 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 ODR4Q5SWX8 454 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 TMEM192Q8IY95 271 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 TBCKQ8TEA7 893 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 FAM167AQ96KS9 214 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 RIT2Q99578 217 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.89■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 TRANK1O15050 2925 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 PTPRSQ13332 1948 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 DISC1Q9NRI5 854 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 PADI3Q9ULW8 664 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 GINS2Q9Y248 185 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.88■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 MSH4O15457 936 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 STAG3L1P0CL83 205 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 SFNP31947 248 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 GPM6BQ13491 265 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 METTL13Q8N6R0 699 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 LENG9Q96B70 501 aa22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
DDB1-220ENST00000542337 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms