RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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PTPRU-211ENST00000531385 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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PTPRU-211ENST00000531385 COL1A2P08123 1366 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-211ENST00000531385 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-211ENST00000531385 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-211ENST00000531385 SEPT8Q92599 483 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-211ENST00000531385 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-211ENST00000531385 BACH2Q9BYV9 841 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-211ENST00000531385 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRU-211ENST00000531385 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.12■□□□□ 0.97
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