RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASB1Q9Y576 335 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 IRAK3Q9Y616 596 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSPAN15O95858 294 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTGS1P23219 599 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 LSP1P33241 339 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGBP1P78318 339 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADCY1Q08828 1119 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAPQ12884 760 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSPNQ14714 243 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 RTP5Q14D33 572 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR31Q5SQ13 230 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 VASNQ6EMK4 673 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 C11orf74Q86VG3 221 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASSF3Q86WH2 238 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZZZ3Q8IYH5 903 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC5A5Q92911 643 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC38A3Q99624 504 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMNQ9BXJ7 453 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCIF1Q9H4Z3 704 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 DLL4Q9NR61 685 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOMM22Q9NS69 142 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 GALNT8Q9NY28 637 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALG1L2C9J202 215 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 K7ESF4 209 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ULK1O75385 1050 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL18BPO95998 194 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHGBP05060 677 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TXKP42681 527 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 LIMS1P48059 325 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SESN3P58005 492 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MOGSQ13724 837 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 STILQ15468 1287 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SKIDA1Q1XH10 827 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 BROXQ5VW32 411 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 STK32CQ86UX6 486 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CILP2Q8IUL8 1156 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 E2F7Q96AV8 911 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC39A2Q9NP94 309 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 INCENPQ9NQS7 918 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCTD3Q9Y597 815 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCAF2A6NFQ2 919 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PI3P19957 117 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD40P25942 277 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MC4RP32245 332 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ECE1P42892 770 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAP1GAPP47736 663 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 EVA1CP58658 441 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANAPC15P60006 121 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDB1Q16531 1140 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 FRMD7Q6ZUT3 714 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLRN3Q8NCR9 226 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 STAG1Q8WVM7 1258 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAML3Q96JK9 1138 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PWWP2AQ96N64 755 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLIC6Q96NY7 704 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 FOXB1Q99853 325 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 MENTQ9BUN1 341 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTBD2Q9BX70 525 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 VTA1Q9NP79 307 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCND1Q9NSA2 647 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 SH3D21A4FU49 640 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP7B1O75881 506 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRKD3O94806 890 aa3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms