RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506453.1

GRSF1-205, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 3

Gene GRSF1, Length 925 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-205	ENST00000506453	NDUFV1	P49821	464 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	CLUL1	Q15846	466 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	USH1G	Q495M9	461 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	SUSD6	Q92537	303 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	TBC1D5	Q92609	795 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	FSD1	Q9BTV5	496 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GRSF1-205	ENST00000506453	LINC01565	O15544	149 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	STAM2	O75886	525 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	NRCAM	Q92823	1304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	PRR23A	A6NEV1	266 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ENPP3	O14638	875 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	GGPS1	O95749	300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	FGA	P02671	866 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	LGALS2	P05162	132 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	CD46	P15529	392 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	SP2	Q02086	613 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	UBE3A	Q05086	875 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	IGFLR1	Q9H665	355 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	OPLAH	O14841	1288 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	GLP2R	O95838	553 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	CHRNA1	P02708	482 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ITGB1	P05556	798 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	MGAT3	Q09327	533 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	TRAF1	Q13077	416 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	NEDD9	Q14511	834 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	PGM5	Q15124	567 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	VPS53	Q5VIR6	699 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	METTL7B	Q6UX53	244 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	PLXNA3	P51805	1871 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	MYO7A	Q13402	2215 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	DNAJB1	P25685	340 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	KCNC3	Q14003	757 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	LPIN1	Q14693	890 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	PNMA1	Q8ND90	353 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	ESR2	Q92731	530 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	MTMR8	Q96EF0	704 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	AMN	Q9BXJ7	453 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	TOMM22	Q9NS69	142 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	TTC3	P53804	2025 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GRSF1-205	ENST00000506453		H0Y858	1186 aa		10.04	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms