RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	SPC25	Q9HBM1	224 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	HTT	P42858	3142 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	MMP3	P08254	477 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	DGKD	Q16760	1214 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	SV2B	Q7L1I2	683 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	GLG1	Q92896	1179 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	TNMD	Q9H2S6	317 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842		A6NJR5	290 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842		E9PMD0	336 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	EYA4	O95677	639 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	PSMC6	P62333	389 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC15	Q8TF66	581 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	PCYT2	Q99447	389 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	MSC	O60682	206 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	PLA2G4B	P0C869	781 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	SLC26A2	P50443	739 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	AMPD3	Q01432	767 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	MCM6	Q14566	821 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	CAMK4	Q16566	473 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	PAGE5	Q96GU1	130 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF862	O60290	1169 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	AFM	P43652	599 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	GJA9	P57773	515 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	PRKCE	Q02156	737 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ARID2	Q68CP9	1835 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842		A0A087WWV3	80 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	LGALS2	P05162	132 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	XKR3	Q5GH77	459 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	FAM167A	Q96KS9	214 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	POSTN	Q15063	836 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		31.8	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	OAT	P04181	439 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	MYL1	P05976	194 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	31.79	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB39	O15060	712 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	KPNA6	O60684	536 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	SLC12A3	P55017	1021 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	NKX3-2	P78367	333 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	TRIM50	Q86XT4	487 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	STAM	Q92783	540 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ZEB2	O60315	1214 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	ANO5	Q75V66	913 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	MTR	Q99707	1265 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
TTC19-208	ENST00000497842	STBD1	O95210	358 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF286B	P0CG31	522 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	ATP4A	P20648	1035 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	BEX3	Q00994	111 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	XKR9	Q5GH70	373 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	GPBP1	Q86WP2	473 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	31.76	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	SMC2	O95347	1197 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	PGK1	P00558	417 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC19-208	ENST00000497842	MARK3	P27448	753 aa		31.75	■■■□□ 2.67

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