RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491933.1

KIAA1109-215, Transcript of KIAA1109, humanhuman

TSL 3

Gene KIAA1109, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1109-215ENST00000491933 TM4SF20Q53R12 229 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TECPR2O15040 1411 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 MST1RQ04912 1400 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.31□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ABCA3Q99758 1704 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 MEIS1O00470 390 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 PRKCAP17252 672 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 EPHB3P54753 998 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TMF1P82094 1093 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CYP4F8P98187 520 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 RTP2Q5QGT7 225 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 SYT8Q8NBV8 401 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 BVESQ8NE79 360 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 MZB1Q8WU39 189 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 MFSD3Q96ES6 412 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.3□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ATP7BP35670 1465 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 A0A1W2PQU0 124 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TSPAN6O43657 245 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ALDH1L1O75891 902 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CDR1P51861 262 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 UBE4AQ14139 1066 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 NUP43Q8NFH3 380 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.29□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 A0A087X0B3 334 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 MATN3O15232 486 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ITGAVP06756 1048 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 FGFR1P11362 822 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 SDHBP21912 280 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 HSPA1LP34931 641 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 KIR3DS1Q14943 382 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 NR1I3Q14994 352 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 LRRC41Q15345 812 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 BRINP3Q76B58 766 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TMC6Q7Z403 805 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 NIM1KQ8IY84 436 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 JMJD8Q96S16 334 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 TESK2Q96S53 571 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 PIK3C2AO00443 1686 aa6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
KIAA1109-215ENST00000491933 ACEP12821 1306 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 NRKQ7Z2Y5 1582 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 ALS2Q96Q42 1657 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 PPFIA4O75335 1185 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 SCG5P05408 212 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 EPHB1P54762 984 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 VMACQ2NL98 169 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 SV2CQ496J9 727 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 C4orf46Q504U0 113 aa6.27□□□□□ -1.41
KIAA1109-215ENST00000491933 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms