RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 ENTPD3O75355 529 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 GNAI2P04899 355 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 GTF2A2P52657 109 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 SP3Q02447 781 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 PPATQ06203 517 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 TCP10Q12799 353 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 ORC1Q13415 861 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 C17orf99Q6UX52 265 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 TMC7Q7Z402 723 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 ATL2Q8NHH9 583 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 PMM1Q92871 262 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 WDR18Q9BV38 432 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 GPR108Q9NPR9 543 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 TRIM17Q9Y577 477 aa7.15□□□□□ -1.26
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF236Q9UL36 1845 aa7.15□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 VGLL3A8MV65 326 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 NDUFB5O43674 189 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TLR2O60603 784 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 BTDP43251 543 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 JAG1P78504 1218 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 AP3B2Q13367 1082 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TNNI3KQ59H18 835 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SPATA5Q8NB90 893 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 UBXN4Q92575 508 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ERO1AQ96HE7 468 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF333Q96JL9 665 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DNAJC18Q9H819 358 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 USP40Q9NVE5 1235 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CSADQ9Y600 493 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.14□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM200BP0CF97 657 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CETPP11597 493 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 BDNFP23560 247 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 GYS2P54840 703 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ATP8B2P98198 1209 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SNAPC2Q13487 334 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 MVPQ14764 893 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 C4orf46Q504U0 113 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DCAF15Q66K64 600 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CEP85Q6P2H3 762 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 GIPC2Q8TF65 315 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SHISA4Q96DD7 197 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ABCB6Q9NP58 842 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 MYH4Q9Y623 1939 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 KIF20AO95235 890 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 DSC3Q14574 896 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ITFG2Q969R8 447 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 HOOK2Q96ED9 719 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM129BQ96TA1 746 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 ABCF2Q9UG63 623 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-208ENST00000490669 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms