RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 MMEP08473 750 aa6.76□□□□□ -1.33
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CCL20-204ENST00000489160 ADCY1Q08828 1119 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 ITKQ08881 620 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 RGL3Q3MIN7 710 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 CD276Q5ZPR3 534 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.76□□□□□ -1.33
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CCL20-204ENST00000489160 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.74□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 VASNQ6EMK4 673 aa6.74□□□□□ -1.33
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CCL20-204ENST00000489160 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.74□□□□□ -1.33
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CCL20-204ENST00000489160 ODR4Q5SWX8 454 aa6.72□□□□□ -1.33
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CCL20-204ENST00000489160 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.72□□□□□ -1.33
CCL20-204ENST00000489160 C7orf31Q8N865 590 aa6.72□□□□□ -1.33
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CCL20-204ENST00000489160 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.72□□□□□ -1.33
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CCL20-204ENST00000489160 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 DTX3Q8N9I9 347 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 FOXB1Q99853 325 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SGPP1Q9BX95 441 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.71□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 GCM1Q9NP62 436 aa6.71□□□□□ -1.34
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