RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 EYA4O95677 639 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 INSRRP14616 1297 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 NRIP1P48552 1158 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 GATMP50440 423 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 IER5Q5VY09 327 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 NPAS4Q8IUM7 802 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF654Q8IZM8 581 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 EFHBQ8N7U6 833 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PHOX2BQ99453 314 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 KMT2EQ8IZD2 1858 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM221A6NGB7 291 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 M0R296 226 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MTMR1Q13613 665 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2SQ16763 222 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 NAALADL2Q58DX5 795 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM67Q6ZTA4 783 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 CRIPAKQ8N1N5 446 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SMRP1Q8NCR6 262 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PRSS33Q8NF86 280 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 POF1BQ8WVV4 589 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX21Q969T3 373 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PADI3Q9ULW8 664 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPC6Q9Y210 931 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 M0QZ92 97 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PPFIA3O75145 1194 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 DDAH1O94760 285 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 STAG3L1P0CL83 205 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SCG2P13521 617 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF5BP33176 963 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PAK2Q13177 524 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 IER5LQ5T953 404 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 RUFY2Q8WXA3 655 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PCYT2Q99447 389 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 LY9Q9HBG7 655 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MYO15AQ9UKN7 3530 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MYO10Q9HD67 2058 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM186AA6NE01 2351 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 LOC730098B7Z3J9 87 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SEC24BO95487 1268 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 GLP2RO95838 553 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 COASYQ13057 564 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TTC22Q5TAA0 569 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP3K14Q99558 947 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 AZI2Q9H6S1 392 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 LRFN2Q9ULH4 789 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SQORQ9Y6N5 450 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SPDYE3A6NKU9 549 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 RXRAP19793 462 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 CHMLP26374 656 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SMARCA1P28370 1054 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MCM4P33991 863 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 ZXDAP98168 799 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM10P98175 930 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 LZTS2Q9BRK4 669 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TMX1Q9H3N1 280 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 TLE6Q9H808 572 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 JADE2Q9NQC1 790 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC9A2Q9UBY0 812 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 VPS13AQ96RL7 3174 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PER2O15055 1255 aa13.41□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 GNAQP50148 359 aa13.41□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 PTPN5P54829 565 aa13.41□□□□□ -0.26
RABGEF1-207ENST00000484547 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms