RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477743.1

MFSD1-212, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-212ENST00000477743 PRR20DP86480 221 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 PRR20BP86481 221 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 PRR20AP86496 221 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 ICA1Q05084 483 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 KLRC3Q07444 240 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 KIF5AQ12840 1032 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 Q4G0T1 1027 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 DACT2Q5SW24 774 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 KIFC2Q96AC6 838 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 MBOAT7Q96N66 472 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 PNMA5Q96PV4 448 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 DESI2Q9BSY9 194 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 CPVLQ9H3G5 476 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 SH2D4AQ9H788 454 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 PANK4Q9NVE7 773 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 ZNF358Q9NW07 568 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 MYO6Q9UM54 1294 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 USTQ9Y2C2 406 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-212ENST00000477743 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 COL4A1P02462 1669 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 SNED1Q8TER0 1413 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 CCDC151A5D8V7 595 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 TRAF5O00463 557 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 PSMD14O00487 310 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 CETN3O15182 167 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 SLC37A4O43826 429 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 ECE2O60344 883 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 COBLO75128 1261 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 TDP2O95551 362 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 CYP3A4P08684 503 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 PLA2G4BP0C869 781 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 MUTP22033 750 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 CIITAP33076 1130 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 SLC16A2P36021 539 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 RELBQ01201 579 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 MTF1Q14872 753 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 PTPN21Q16825 1174 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 KCTD1Q719H9 257 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 NEK11Q8NG66 645 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 HAS1Q92839 578 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 HINFPQ9BQA5 517 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 MXD3Q9BW11 206 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 ANO3Q9BYT9 981 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 PNMA2Q9UL42 364 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 BTAF1O14981 1849 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 ANO9A1A5B4 782 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 FAM187AA6NFU0 413 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 PRMT3O60678 531 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 PLA2G6O60733 806 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-212ENST00000477743 TACC1O75410 805 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms