RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476089.1

ITGA4-207, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA4, Length 1,846 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-207ENST00000476089 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.68■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 PSAPP07602 524 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 CYP2C8P10632 490 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 GUCY2CP25092 1073 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 ICAM3P32942 547 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 CCNA1P78396 465 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 ASTN1O14525 1302 aa22.67■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 UBXN1Q04323 297 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 PADI6Q6TGC4 694 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 BTBD19C9JJ37 291 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 TPM1P09493 284 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 EDNRBP24530 442 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 PBX1P40424 430 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.66■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 LGALS16A8MUM7 142 aa22.65■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 GCNT3O95395 438 aa22.65■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 RARRES1P49788 294 aa22.65■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 CCZ1BP86790 482 aa22.65■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.65■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.65■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 SFI1A8K8P3 1242 aa22.64■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 UGCGQ16739 394 aa22.64■■□□□ 1.22
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ITGA4-207ENST00000476089 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.64■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 SPRYD7Q5W111 196 aa22.64■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.64■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.64■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
ITGA4-207ENST00000476089 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.64■■□□□ 1.22
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ITGA4-207ENST00000476089 ZNF131P52739 623 aa22.64■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 ACTR2P61160 394 aa22.64■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 TIPINQ9BVW5 301 aa22.64■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.64■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 HIP1RO75146 1068 aa22.63■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 MYBP10242 640 aa22.63■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 ODR4Q5SWX8 454 aa22.63■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.63■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 TRIM14Q14142 442 aa22.62■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 XKR9Q5GH70 373 aa22.62■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 CHADLQ6NUI6 762 aa22.62■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.62■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.62■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.62■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.61■■□□□ 1.21
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ITGA4-207ENST00000476089 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.61■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 PDXKO00764 312 aa22.61■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 BACH1O14867 736 aa22.61■■□□□ 1.21
ITGA4-207ENST00000476089 SORBS3O60504 671 aa22.61■■□□□ 1.21
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