RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 MYO7AQ13402 2215 aa13.32□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 ZNF318Q5VUA4 2279 aa13.32□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 ENPP3O14638 875 aa13.32□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 GRM6O15303 877 aa13.32□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 MAFGO15525 162 aa13.32□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 CHRNA1P02708 482 aa13.32□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 SMARCA1P28370 1054 aa13.32□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 LPIN1Q14693 890 aa13.32□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 EDAQ92838 391 aa13.32□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa13.32□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 TTC3P53804 2025 aa13.32□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.29□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 TEX2Q8IWB9 1127 aa13.29□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 PRSS33Q8NF86 280 aa13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 PDRG1Q9NUG6 133 aa13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 TELO2Q9Y4R8 837 aa13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 DOCK5Q9H7D0 1870 aa13.29□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa13.28□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 KCNA2P16389 499 aa13.28□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 IER5LQ5T953 404 aa13.28□□□□□ -0.28
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PRAME-210ENST00000442481 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 TRPC6Q9Y210 931 aa13.28□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PRAME-210ENST00000442481 TMEM221A6NGB7 291 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-210ENST00000442481 M0R296 226 aa13.27□□□□□ -0.29
PRAME-210ENST00000442481 MEIS2O14770 477 aa13.27□□□□□ -0.29
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