RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 ERMNQ8TAM6 284 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 HIPK3Q9H422 1215 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 RGL1Q9NZL6 768 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 CLIC4Q9Y696 253 aa20.5■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 COL1A2P08123 1366 aa20.49■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 H0YGN5 161 aa20.49■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 BRD1O95696 1058 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTX4-202ENST00000440447 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.49■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.49■□□□□ 0.87
PTX4-202ENST00000440447 STK24Q9Y6E0 443 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTX4-202ENST00000440447 C4orf19Q8IY42 314 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTX4-202ENST00000440447 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTX4-202ENST00000440447 TMEM150BA6NC51 233 aa20.43■□□□□ 0.86
PTX4-202ENST00000440447 PP2D1A8MPX8 630 aa20.43■□□□□ 0.86
PTX4-202ENST00000440447 CAND2O75155 1236 aa20.43■□□□□ 0.86
PTX4-202ENST00000440447 C22orf31O95567 290 aa20.43■□□□□ 0.86
PTX4-202ENST00000440447 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTX4-202ENST00000440447 CKBP12277 381 aa20.43■□□□□ 0.86
PTX4-202ENST00000440447 MUTP22033 750 aa20.43■□□□□ 0.86
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