RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 TOP1MTQ969P6 601 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CD320Q9NPF0 282 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.13□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PIK3CDO00329 1044 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CHRNA1P02708 482 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 KCNA2P16389 499 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 ITGB5P18084 799 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CTNNB1P35222 781 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 NUCB2P80303 420 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 MTMR1Q13613 665 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TMEM192Q8IY95 271 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 BANK1Q8NDB2 785 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 APBB2Q92870 758 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GLG1Q92896 1179 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GPRASP2Q96D09 838 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 FAM122AQ96E09 287 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 SAMD11Q96NU1 681 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 NRCAMQ92823 1304 aa14.12□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 STXBP3O00186 592 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PLA2G5P39877 138 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 ADAM17P78536 824 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GUCY1B3Q02153 619 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GRIK4Q16099 956 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CDHR1Q96JP9 859 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 BARHL2Q9NY43 387 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 MTMR6Q9Y217 621 aa14.11□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 H3BNC9 293 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 NAPAP54920 295 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PKP1Q13835 747 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 LPIN1Q14693 890 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 FAM26DQ5JW98 314 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 RSPH3Q86UC2 560 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 FIBCD1Q8N539 461 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PGBD1Q96JS3 809 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.1□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 BRD1O95696 1058 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 NLRP5P59047 1200 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 MGAT3Q09327 533 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TMEM62Q0P6H9 643 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 GJD3Q8N144 294 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 CLDND1Q9NY35 253 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 TRPC6Q9Y210 931 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.09□□□□□ -0.15
PRAME-208ENST00000438888 ESYT2A0FGR8 921 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 MMP1P03956 469 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 CD52P31358 61 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 CLUL1Q15846 466 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.08□□□□□ -0.16
PRAME-208ENST00000438888 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms